Takayuki Morimoto gioca per la nazionale maggiore giapponese.
Ha inoltre fatto parte della Nazionale Giapponese under 20 Nft ai Campionati Mondiali Giovanili FIFA del 2005 e nei Campionati Giovanili AFC del 2004.
L'attuale allenatore della nazionale è Alberto Zaccheroni che tiene in grande considerazione il "Ronaldo del Sol Levante".
In nazionale ha disputato 9 presenze realizzando 3 gol
Il primo gol di Takayuki Morimoto con la maglia della nazionale giapponese